primer5官方版是用戶生物學(xué)領(lǐng)域的測序引物以及雜交探針的設(shè)計(jì)軟件，軟件功能非常的豐富，能夠幫助顯示各種生物參數(shù)，將分析結(jié)果完整呈現(xiàn)出來。

primer5引物設(shè)計(jì)軟件介紹

該軟件就是用來進(jìn)行引物設(shè)計(jì)的。可以簡單地通過手動拖動鼠標(biāo)以擴(kuò)增出相應(yīng)片段所需的引物，而在手動的任何時(shí)候，下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等。也可以給定條件，讓軟件自動搜索引物，并將引物分析結(jié)果顯示出來。而且進(jìn)行這些操作非常簡單。

primer5.0安裝包功能

1、主要界面是分為GeneTank(序列編輯)、Primer(引物設(shè)計(jì))、Aling(序列比較)、Enzyme(酶切分析)和Mitif(基序分析)。

2、該軟件就是用來進(jìn)行引物設(shè)計(jì)的

3、可以簡單地通過手動拖動鼠標(biāo)以擴(kuò)增出相應(yīng)片段所需的引物

4、在手動的任何時(shí)候，下面顯示各種參數(shù)的改變和可能的二聚體、異 二聚體、發(fā)夾結(jié)構(gòu)等，也可以給定條件，讓軟件自動搜索引物，并將引物分析結(jié)果顯示出來

5、使用Primer Premier，操作非常簡單

軟件特色

1、病理檢測引物設(shè)計(jì)

可以用在高保區(qū)域設(shè)計(jì)引物

2、種間交叉引物設(shè)計(jì)

利用來自多個(gè)物種的序列設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物

3、等位基因特效引物

設(shè)計(jì)專用于擴(kuò)增某一類相關(guān)序列中特定成員的引物

primer5設(shè)計(jì)引物教程

1、先在NCBI這個(gè)網(wǎng)站上找到自己需要的基因序列，mRNA或者DNA都可。

2、運(yùn)行Primer 5.exe。

3、點(diǎn)擊左上角File-New-DNA Sequence。

4、將自己得到的DNA或者RNA粘貼至空白處。

5、貼之后會彈出窗口，系統(tǒng)自動選擇“As is”，直接點(diǎn)擊OK即可。

6、粘貼成功，點(diǎn)擊“primer”，在左上方彈出窗口，選擇“search”，彈出引物搜索框，其他選項(xiàng)一般不需要更改，如果需要的產(chǎn)物長度有些要求可以更改，如果無需更改，或者更改完畢后點(diǎn)擊“OK”。

7、自動搜索完畢后，點(diǎn)擊“OK”，右上角出現(xiàn)搜索結(jié)果，并且按系統(tǒng)評分排序，共一百對引物。

8、點(diǎn)擊某一行結(jié)果，在左上角的“引物窗口”中，會顯示該引物的詳細(xì)信息。

9、通過對比查看引物，從中選擇合適的引物：在搜索結(jié)果框中該引物一行的方框后打?qū)础｜c(diǎn)擊Fuction-Save to datebase，彈出“primer database ”對話框，點(diǎn)擊自己要加的引物序列，點(diǎn)擊“Export”，引物序列就會在“Primers”下方出現(xiàn)，點(diǎn)擊“Save”，以后即可查看。

10、如果合適的引物就一兩個(gè)，也可以直接用虛擬打印機(jī)轉(zhuǎn)化成pdf格式。前提是要有一個(gè)虛擬打印機(jī)的軟件，我用的是bio PDF軟件。點(diǎn)擊合適的引物，點(diǎn)擊File-Print-Current Pair，彈出“Print primer”窗口，點(diǎn)擊“print”。

11、彈出“打印設(shè)置”選項(xiàng)，直接確定即可，彈出PDF生成文件，點(diǎn)擊“保存”，在桌面上就有了該pdf文件，文件里面記錄該序列詳細(xì)信息。